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Détection d'ARN par LAMP sur l'Optigene Genie II/III. Système en tube fermé, amplification de 30 min à 66 °C, confirmation par courbe d'hybridation. Étape 3 du système de surveillance des arbovirus ProAmpRT™ in-house.
Validation indépendante
Burkhalter et al., J Med Entomol 2018 (PMID: 29462341)
PLM-1008 est l'étape de détection LAMP. Selon la procédure du MUI :
15 µL de mélange maître + 4,975 µL de mélange d'amorces WNV_E + 0,025 µL de transcriptase inverse par réaction. Ajuster pour le cycle + 2 supplémentaires. Aliquoter 20 µL dans chaque puits de bande de 8 tubes Optigene.
Ajouter 5 µL d'ARN extrait à chaque tube et refermer immédiatement. Volume de réaction total : 25 µL. Utiliser une zone d'ajout de template distincte de la préparation pré-amplification pour contrôler la contamination.
Amplification : 66 °C × 30 min. Hybridation : 98 °C → 80 °C à 0,05 °C/sec. Examiner les courbes d'amplification et le pic d'hybridation (WNV positif : 86,4–88,4 °C).
Source : PLM-1008 MUI Ver : 160601
Aucun cycle thermique. Les tubes restent fermés après l'exécution — selon le MUI, « ne pas ouvrir après l'exécution » pour prévenir la contamination des amplicons.
Étape de confirmation intégrée. Le Genie effectue une rampe de 98 °C à 80 °C à 0,05 °C/sec; le pic d'hybridation distingue un véritable WNV positif des artefacts d'amplification.
Burkhalter et al. (2018) ont comparé ProAmpRT LAMP, RAMP et RT-PCR sur des cartes de miel; ProAmpRT a détecté le WNV/ZIKV à plusieurs titres où RAMP n'a retourné aucun positif.
Responsabilité d'un seul fournisseur. Pro-Lab fournit l'homogénéisation, l'extraction d'ARN et la détection LAMP — ensemble complet du MUI, un seul contact pour le soutien technique.
Si vous envoyez des pools au laboratoire d'État, le rythme est le même chaque saison — soumettre lundi, espérer jeudi, et pendant la période de pointe, le plafond peut rejeter vos soumissions. PLM-1008 ferme la boucle in-house. Ajouter 5 µL d'ARN extrait à un tube de mélange d'amplification, exécuter 30 minutes à 66 °C sur l'Optigene Genie II/III, lire le pic d'hybridation (86,4–88,4 °C confirme WNV positif). Résultat de surveillance le même jour, pour chaque pool, chaque jour.
La procédure est identique à chaque exécution. Décongeler le mélange d'amorces et le mélange maître sur glace. Combiner : 15 µL de mélange maître + 4,975 µL de mélange d'amorces WNV_E + 0,025 µL de transcriptase inverse = 20 µL de mélange d'amplification ; + 5 µL d'ARN extrait = 25 µL au total. Exécuter sur Genie II/III : 66 °C × 30 min, puis hybridation 98 °C → 80 °C à 0,05 °C/sec. Lire à la fois la courbe d'amplification et le pic d'hybridation. Tube fermé — ne pas ouvrir après l'exécution.
Les laboratoires de santé publique ont besoin de trois choses pour adopter une méthode de surveillance : le protocole par écrit, une évaluation indépendante, et un fournisseur qui approvisionne tout le flux de travail. PLM-1008 possède les trois. L'IFU spécifie l'amplification à 66 °C × 30 min, l'hybridation 98 °C → 80 °C à 0,05 °C/sec, et un pic d'hybridation à 86,4–88,4 °C comme signal positif pour le VNO. Burkhalter et coll. (2018) ont comparé ProAmpRT™ LAMP, RAMP et RT-PCR en temps réel sur des spécimens de carte de miel ; LAMP a détecté des échantillons VNO/ZIKV que RAMP a retournés comme négatifs.Pour usage en recherche uniquement — surveillance du contrôle des vecteurs, non diagnostic clinique de patient.
PLM-1008 est l'étape de détection. L'associer avec l'homogénéisation et l'extraction d'ARN en amont du même fabricant.
Tubes de 2,0 mL pré-remplis avec billes et tampon de broyage. Pools n ≤ 50, 100 préparations par kit.
Plaques d'extraction pré-chargées conçues pour l'instrument Mag Pro-32 — 32 échantillons par exécution.
Extraction magnétique automatisée de 32 échantillons avec décontamination UV intégrée.
Extraction d'ARN sur colonne de silice avec protocole de moustique publié. Flux de travail manuel — aucun instrument requis.
Extraction d'ARN par perles magnétiques manuelles avec aimant portatif. Débit flexible ; aucun instrument requis.
Lecteur LAMP isotherme requis avec analyse d'amplification et d'hybridation. Spécifié par l'IFU PLM-1008.
| Spécification | Valeur |
|---|---|
| Numéro de catalogue | PLM-1008 |
| Type de produit | LAMP Primer Mix Kit (RUO) |
| Désignation RUO | « Non destiné à un usage clinique. » Recherche uniquement — surveillance des vecteurs, non diagnostic clinique |
| Réactions par kit | 100 |
| Contenu du kit | Pro-AmpRT WNV_E Primer Mix (PLM-1008); Pro-AmpRT Master Mix (PLM-501); Pro-AmpRT Reverse Transcriptase (PLM-500) |
| Configuration par réaction | 15 µL Master Mix + 4,975 µL WNV_E Primer Mix + 0,025 µL Reverse Transcriptase = 20 µL mélange d'amplification; + 5 µL échantillon = 25 µL total |
| Lecteur de détection | Optigene Genie II / Genie III |
| Tubes en bandes | Optigene 8 Tube Strips (n° cat. OP-0008) |
| Amplification | 66 °C × 30 min |
| Hybridation | 98 °C → 80 °C à 0,05 °C/sec |
| Pic d'hybridation WNV | 86,4 – 88,4 °C |
| Méthode de détection | Fluorescence (tube fermé) |
| Spécimen | ARN extrait (à partir du flux de travail en amont PLM-2008 → PLM-2007 / PLM-2004 / PLM-2000) |
| Expédition au froid | Requise (note du fabricant) |
| Classification SGH | Non classifié comme dangereux selon le SGH. NFPA : Santé 0 / Feu 1 / Réactivité 0. Source : PLM-500 (Reverse Transcriptase) FDS + PLM-PrimerMix (série PLM-1000) FDS. Composants confirmés non dangereux selon l'OSHA 29CFR1910.1200 / EU CLP. La chimie de tampon du produit similaire (PLM-2000 / PLM-2004 IFUs) divulgue l'azide de sodium 0,05 % comme conservateur — s'applique au master mix PLM-501; ne pas éliminer les réactifs inutilisés dans les égouts. |
| Fabricant | Pro-Lab Diagnostics USA |
Spécifications provenant de la PLM-1008 IFU Ver: 160601. Classification des risques SGH confirmée à partir des FDS du composant PLM-500 (enzyme RT) et PLM-PrimerMix — tous deux non dangereux selon l'OSHA / SGH. Stockage par SKU et durée de conservation en attente de confirmation de Pro-Lab Diagnostics; consulter l'IFU du kit pour la manipulation spécifique aux composants.
Tarification pour votre district ou programme en l'espace d'un jour ouvrable.
Démonstration du système ProAmpRT de 20 minutes — virtuelle ou sur place.
PLM-1008 · 100 réactions par trousse · consommables ProAmpRT.
Applications de contrôle vectoriel · (512) 832-9145
Réservé à la recherche — Non destiné aux procédures diagnostiques. La Trousse isotherme Pro-AmpRT WNV (PLM-1008) est désignée Réservé à la recherche selon l'en-tête de l'IFU (Ver: 160601 — verbatim « Non destiné à l'utilisation clinique »). Le système est destiné à la surveillance du contrôle vectoriel et de la santé publique — non au diagnostic clinique des patients. L'étude Burkhalter et al. (J Med Entomol. 2018; PMID: 29462341) a évalué des spécimens de cartes de miel, non des homogénats de pools de moustiques; le rendement dans les pools de moustiques peut différer. La condition de run « amplification de 30 min à 66 °C » est verbatim de l'IFU PLM-1008 Ver: 160601.
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